Übersetze RNA-Sequenzen in Proteine.
Man kann RNA in Sequenzen aus jeweils drei Nukleotiden zerlegen, die Codons genannt werden, und diese dann wie folgt in ein Polypeptid übersetzen:
RNA: "AUGUUUUCU" => wird übersetzt zu
Codons: "AUG", "UUU", "UCU"
=> daraus entsteht ein Polypeptid mit der folgenden Sequenz =>
Protein: "Methionine", "Phenylalanine", "Serine"
Es gibt 64 Codons, die wiederum 20 Aminosäuren entsprechen. In dieser Übung sind jedoch nicht alle Codonsequenzen und die daraus entstehenden Aminosäuren wichtig. Wenn es für ein Codon funktioniert, sollte das Programm für alle funktionieren. Du kannst die Liste in der Testsuite aber gerne erweitern, um alle aufzunehmen.
Außerdem gibt es drei terminierende Codons (auch als „STOP“-Codons bekannt). Trifft das Ribosom auf eines dieser Codons, endet die gesamte Translation und das Protein wird beendet.
Alle danach folgenden Codons werden ignoriert, so wie hier:
RNA: "AUGUUUUCUUAAAUG" =>
Codons: "AUG", "UUU", "UCU", "UAA", "AUG" =>
Protein: "Methionine", "Phenylalanine", "Serine"
Beachte, dass das Stopp-Codon "UAA" die Translation beendet und das letzte Methionin nicht in die Proteinsequenz übersetzt wird.
Unten stehen die Codons und die daraus entstehenden Aminosäuren, die für die Übung benötigt werden.
| Codon | Protein |
|---|---|
| AUG | Methionine |
| UUU, UUC | Phenylalanine |
| UUA, UUG | Leucine |
| UCU, UCC, UCA, UCG | Serine |
| UAU, UAC | Tyrosine |
| UGU, UGC | Cysteine |
| UGG | Tryptophan |
| UAA, UAG, UGA | STOP |
Erfahre mehr über die Protein-Translation auf Wikipedia
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