タンパク質の翻訳

説明

この演習の目標は、RNAの配列をタンパク質に翻訳することです。

RNA鎖は、コドンと呼ばれる3つのヌクレオチドからなる配列でできています。それぞれのコドンは、1つのアミノ酸に翻訳されます。それらのアミノ酸がつながると、タンパク質になります。

実際には、コドンは64種類あり、それらは20種類のアミノ酸に対応しています。ただし、この演習で使うのは、その64種類のうちのほんの一部だけです。使うものは次のとおりです。

たとえば、RNAの文字列「AUGUUUUCU」には「AUG」「UUU」「UCU」という3つのコドンがあります。これらはそれぞれMethionine、Phenylalanine、Serineに対応します。

「STOP」コドン

上の表を見ると、「STOP」コドンが3つあることがわかります。これらのコドンのいずれかに出会ったら、それ以降の配列は無視します。タンパク質はそこで完成しているからです。

たとえば、「AUGUUUUCUUAAAUG」には「STOP」コドン（「UAA」）が含まれています。その時点に達したら、そこで処理をやめます。したがって、考えるのはその手前の部分（つまり「AUGUUUUCU」）だけで、それより後ろのコドン（つまり「AUG」）は使いません。

もっと詳しく知りたい場合は、Wikipediaのタンパク質の翻訳を参照してください。